整個實驗室項目的施工流程其實跟其他機電安裝的施工流程區別并不是很大，本身從系統上，也就是機電管道的安裝、設備的安裝以及裝飾的安裝，整體的施工就是這三部分的有機結合，特別是機電管道跟裝飾安裝的結合，不同的裝飾做法會要求不同的施工流程。
常規的流程是先做地面的找平，同步可以做機電主管道的安裝，這2個步驟前后施工都可以，只是地面找平時，人員在施工區域沒法施工，所以還是看時間及計劃的安排，此階段各類大型設備的采購都可以同步進行。
基本上主管道完成后，隔墻就可以按照做了，有些時間比較緊的，將隔墻跟主管道一起施工也可以，但是需要相互間做好配合，很多管道穿隔墻需要做好預留孔，對于一些不到頂的隔墻可以先做，后期在吊頂上再做管道都可以，不過必須吊頂內空間足夠，不然就沒法施工。
部分要求潔凈度比較高的管道最好等室內各類灰塵大的施工做好再做，避免污染，或者提前做好防護措施。
完成主管道與隔墻的施工后，基本就可以按照支管及吊頂，此時主要設備也基本可以到貨，同步可以做設備的安裝，以及在吊頂內設備的吊裝，這中間會存在比較多需要協調的地方，畢竟吊頂內空間有限，各類支管如果提前沒有排好，或者做過BIM的碰撞檢查的話，很容易產生各類交叉的問題，所以此時最好每天都開會協調，溝通，減少問題的出現和返工。
最后主要是做各類感官工程的施工，比如燈具、插座，風口安裝，地面的施工等等，這類感官工程方面的施工，關于到項目的整體形象，是非常重要的一部分，等現場都做好基本的衛生后，可以做家具的安裝。